Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SCP2D1Q9UJQ7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCP2D1Q9UJQ7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCP2D1Q9UJQ7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms