Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FBXO40Q9UH90 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO40Q9UH90 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO40Q9UH90 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms