Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEPT3Q9UH03 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms