Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ABCF2Q9UG63 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms