Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
APEX2Q9UBZ4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APEX2Q9UBZ4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms