Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLKQ9UBT6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms