Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRPC4Q9UBN4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPC4Q9UBN4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms