Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAE1Q9UBE0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SAE1Q9UBE0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms