Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DNMT3BQ9UBC3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNMT3BQ9UBC3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms