Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHPF2Q9P2E5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHPF2Q9P2E5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHPF2Q9P2E5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms