Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTN3Q9P232 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN3Q9P232 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms