Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCMF1Q9P0J7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCMF1Q9P0J7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCMF1Q9P0J7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms