Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNIP1Q9NZI2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNIP1Q9NZI2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNIP1Q9NZI2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNIP1Q9NZI2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNIP1Q9NZI2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNIP1Q9NZI2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCNIP1Q9NZI2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNIP1Q9NZI2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNIP1Q9NZI2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNIP1Q9NZI2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNIP1Q9NZI2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNIP1Q9NZI2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNIP1Q9NZI2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNIP1Q9NZI2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP1Q9NZI2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms