Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXC10Q9NYD6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXC10Q9NYD6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC10Q9NYD6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms