Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKN2AIPQ9NXV6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDKN2AIPQ9NXV6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms