Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCM9Q9NXL9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCM9Q9NXL9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms