Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDIT4Q9NX09 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDIT4Q9NX09 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms