Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1orf109Q9NX04 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf109Q9NX04 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms