Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN6Q9NWW5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN6Q9NWW5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms