Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWU1

OXSM, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXSMQ9NWU1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OXSMQ9NWU1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms