Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCM2LQ9NUG4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCM2LQ9NUG4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms