Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HOMER2Q9NSB8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms