Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNBIP1Q9NSA3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms