Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS45Q9NRW7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
VPS45Q9NRW7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS45Q9NRW7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms