Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX1Q9NRD9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DUOX1Q9NRD9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms