Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC31BQ9NQW1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEC31BQ9NQW1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms