Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ50

MRPL40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL40Q9NQ50 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPL40Q9NQ50 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL40Q9NQ50 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms