Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MED4Q9NPJ6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED4Q9NPJ6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MED4Q9NPJ6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms