Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA1

KCNMB3, Calcium-activated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB3Q9NPA1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNMB3Q9NPA1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KCNMB3Q9NPA1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNMB3Q9NPA1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms