Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ3

RAVER2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAVER2Q9HCJ3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RAVER2Q9HCJ3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAVER2Q9HCJ3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAVER2Q9HCJ3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RAVER2Q9HCJ3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAVER2Q9HCJ3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAVER2Q9HCJ3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAVER2Q9HCJ3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAVER2Q9HCJ3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAVER2Q9HCJ3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAVER2Q9HCJ3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAVER2Q9HCJ3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAVER2Q9HCJ3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAVER2Q9HCJ3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAVER2Q9HCJ3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAVER2Q9HCJ3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAVER2Q9HCJ3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAVER2Q9HCJ3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAVER2Q9HCJ3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAVER2Q9HCJ3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAVER2Q9HCJ3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms