Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC4Q9HBW1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms