Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPCSQ9HAB8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPCSQ9HAB8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms