Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf88Q9H8K7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C10orf88Q9H8K7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms