Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NXF3Q9H4D5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms