Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4B8

DPEP3, Dipeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPEP3Q9H4B8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DPEP3Q9H4B8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DPEP3Q9H4B8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DPEP3Q9H4B8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DPEP3Q9H4B8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DPEP3Q9H4B8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DPEP3Q9H4B8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DPEP3Q9H4B8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DPEP3Q9H4B8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DPEP3Q9H4B8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DPEP3Q9H4B8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DPEP3Q9H4B8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DPEP3Q9H4B8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DPEP3Q9H4B8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPEP3Q9H4B8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DPEP3Q9H4B8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DPEP3Q9H4B8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DPEP3Q9H4B8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DPEP3Q9H4B8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DPEP3Q9H4B8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DPEP3Q9H4B8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DPEP3Q9H4B8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DPEP3Q9H4B8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DPEP3Q9H4B8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DPEP3Q9H4B8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DPEP3Q9H4B8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DPEP3Q9H4B8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DPEP3Q9H4B8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DPEP3Q9H4B8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DPEP3Q9H4B8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DPEP3Q9H4B8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DPEP3Q9H4B8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DPEP3Q9H4B8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms