Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00597Q9H2U6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00597Q9H2U6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms