Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMG9Q9H0W8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMG9Q9H0W8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
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