Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC113Q9H0I3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC113Q9H0I3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC113Q9H0I3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms