Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NBPF3Q9H094 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NBPF3Q9H094 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF3Q9H094 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms