Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR7

DDX24, ATP-dependent RNA helicase DDX24, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX24Q9GZR7 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 32.6
DDX24Q9GZR7 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 32.6
DDX24Q9GZR7 POMT1-215ENST00000485278 3420 ntTSL 213.4□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 32.6
DDX24Q9GZR7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.771e-6■■■■■ 32.6
DDX24Q9GZR7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.81e-6■■■■■ 32.6
DDX24Q9GZR7 KLF3-202ENST00000482150 517 ntTSL 217.26■□□□□ 0.351e-6■■■■■ 32.6
DDX24Q9GZR7 PHKB-211ENST00000566436 457 ntTSL 23.01□□□□□ -1.934e-7■■■■■ 32.6
DDX24Q9GZR7 RNF213-210ENST00000560083 4212 ntTSL 28.24□□□□□ -1.093e-7■■■■■ 32.6
DDX24Q9GZR7 STAT6-206ENST00000553275 670 ntTSL 319.08■□□□□ 0.648e-7■■■■■ 32.6
DDX24Q9GZR7 STAT6-213ENST00000554825 644 ntTSL 417.7■□□□□ 0.428e-7■■■■■ 32.6
DDX24Q9GZR7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.058e-7■■■■■ 32.5
DDX24Q9GZR7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.448e-7■■■■■ 32.5
DDX24Q9GZR7 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.187e-7■■■■■ 32.5
DDX24Q9GZR7 NUP85-221ENST00000583548 562 ntTSL 57.54□□□□□ -1.24e-7■■■■■ 32.5
DDX24Q9GZR7 NUP85-204ENST00000577208 572 ntTSL 47.02□□□□□ -1.294e-7■■■■■ 32.5
DDX24Q9GZR7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.441e-6■■■■■ 32.5
DDX24Q9GZR7 VPS52-214ENST00000463486 925 ntTSL 521.41■■□□□ 1.023e-7■■■■■ 32.5
DDX24Q9GZR7 VPS52-215ENST00000464425 1060 ntTSL 520.62■□□□□ 0.893e-7■■■■■ 32.5
DDX24Q9GZR7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 32.5
DDX24Q9GZR7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 32.5
DDX24Q9GZR7 SLC44A2-202ENST00000407327 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.652e-6■■■■■ 32.5
DDX24Q9GZR7 THOC5-205ENST00000414902 484 ntTSL 516.68■□□□□ 0.262e-9■■■■■ 32.4
DDX24Q9GZR7 THOC5-207ENST00000428374 729 ntTSL 214.98□□□□□ -0.012e-9■■■■■ 32.4
DDX24Q9GZR7 THOC5-213ENST00000475187 1935 ntTSL 1 (best)14.31□□□□□ -0.122e-9■■■■■ 32.4
DDX24Q9GZR7 THOC5-211ENST00000455450 579 ntTSL 311.24□□□□□ -0.612e-9■■■■■ 32.4
DDX24Q9GZR7 THOC5-208ENST00000440771 1006 ntTSL 310.97□□□□□ -0.652e-9■■■■■ 32.4
DDX24Q9GZR7 HIP1R-202ENST00000452196 2054 ntTSL 1 (best)22.26■■□□□ 1.151e-7■■■■■ 32.4
DDX24Q9GZR7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 32.4
DDX24Q9GZR7 HIP1R-204ENST00000535831 3078 ntTSL 217.9■□□□□ 0.461e-7■■■■■ 32.4
DDX24Q9GZR7 TTF2-202ENST00000427271 639 ntTSL 36.28□□□□□ -1.47e-11■■■■■ 32.4
DDX24Q9GZR7 MAGED2-211ENST00000487482 341 ntTSL 24.05□□□□□ -1.762e-10■■■■■ 32.4
DDX24Q9GZR7 VPS33B-208ENST00000574755 2356 ntTSL 216.69■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 32.4
DDX24Q9GZR7 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 32.4
DDX24Q9GZR7 VPS33B-201ENST00000333371 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 32.4
DDX24Q9GZR7 PDXDC2P-NPIPB14P-204ENST00000530079 2764 ntTSL 515.86■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 32.4
DDX24Q9GZR7 PDXDC2P-NPIPB14P-203ENST00000529089 1580 ntTSL 214.32□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 32.4
DDX24Q9GZR7 PDXDC2P-NPIPB14P-205ENST00000531894 4184 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 32.4
DDX24Q9GZR7 ACACA-245ENST00000619546 5315 ntTSL 1 (best)10.72□□□□□ -0.694e-7■■■■■ 32.4
DDX24Q9GZR7 CPNE1-219ENST00000440240 746 ntTSL 525.07■■□□□ 1.65e-7■■■■■ 32.3
DDX24Q9GZR7 ANO9-207ENST00000532094 5487 ntTSL 221.06■□□□□ 0.965e-8■■■■■ 32.3
DDX24Q9GZR7 ANO9-206ENST00000528927 2639 ntTSL 1 (best)18.67■□□□□ 0.585e-8■■■■■ 32.3
DDX24Q9GZR7 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.175e-8■■■■■ 32.3
DDX24Q9GZR7 DGKQ-202ENST00000502309 818 ntTSL 518.96■□□□□ 0.632e-7■■■■■ 32.3
DDX24Q9GZR7 HDAC10-209ENST00000471375 928 ntTSL 523.51■■□□□ 1.351e-6■■■■■ 32.3
DDX24Q9GZR7 ARHGAP4-221ENST00000488269 960 ntTSL 324.5■■□□□ 1.514e-10■■■■■ 32.3
DDX24Q9GZR7 ARHGAP4-206ENST00000418750 586 ntTSL 421.96■■□□□ 1.114e-10■■■■■ 32.3
DDX24Q9GZR7 FANCI-217ENST00000570225 526 ntTSL 37.07□□□□□ -1.282e-14■■■■■ 32.3
DDX24Q9GZR7 KIAA0907-210ENST00000491599 773 ntTSL 320.27■□□□□ 0.841e-8■■■■■ 32.3
DDX24Q9GZR7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.983e-7■■■■■ 32.3
DDX24Q9GZR7 MRC2-205ENST00000583597 3238 ntTSL 1 (best)16.56■□□□□ 0.243e-7■■■■■ 32.3
DDX24Q9GZR7 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.233e-7■■■■■ 32.3
DDX24Q9GZR7 CELF1-219ENST00000539254 572 ntTSL 411.7□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 32.2
DDX24Q9GZR7 CELF1-220ENST00000539455 800 ntTSL 56.42□□□□□ -1.382e-7■■■■■ 32.2
DDX24Q9GZR7 CHTF18-203ENST00000426047 790 ntTSL 319.79■□□□□ 0.764e-10■■■■■ 32.2
DDX24Q9GZR7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.935e-8■■■■■ 32.2
DDX24Q9GZR7 DEAF1-207ENST00000527170 1623 ntTSL 1 (best)19.45■□□□□ 0.75e-8■■■■■ 32.2
DDX24Q9GZR7 KDM2B-209ENST00000538503 6676 ntTSL 516.14■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 32.2
DDX24Q9GZR7 DEAF1-212ENST00000530813 668 ntTSL 515.69■□□□□ 0.15e-8■■■■■ 32.2
DDX24Q9GZR7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 24e-7■■■■■ 32.2
DDX24Q9GZR7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.824e-7■■■■■ 32.2
DDX24Q9GZR7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.74e-7■■■■■ 32.2
DDX24Q9GZR7 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.554e-7■■■■■ 32.2
DDX24Q9GZR7 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.374e-7■■■■■ 32.2
DDX24Q9GZR7 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.084e-7■■■■■ 32.2
DDX24Q9GZR7 MAPK8IP3-211ENST00000567352 507 ntTSL 216.66■□□□□ 0.263e-7■■■■■ 32.2
DDX24Q9GZR7 DNM1-215ENST00000631179 357 ntTSL 310.9□□□□□ -0.661e-6■■■■■ 32.2
DDX24Q9GZR7 SLC38A5-203ENST00000429543 656 ntTSL 517.57■□□□□ 0.47e-7■■■■■ 32.2
DDX24Q9GZR7 SLC38A5-207ENST00000488083 622 ntTSL 316.99■□□□□ 0.317e-7■■■■■ 32.2
DDX24Q9GZR7 MAST2-205ENST00000470809 640 ntTSL 36.32□□□□□ -1.42e-8■■■■■ 32.1
DDX24Q9GZR7 TAF1C-215ENST00000566183 290 ntTSL 320.7■□□□□ 0.92e-8■■■■■ 32.1
DDX24Q9GZR7 SYMPK-203ENST00000593899 558 ntTSL 414.94□□□□□ -0.023e-7■■■■■ 32.1
DDX24Q9GZR7 SYMPK-216ENST00000601582 544 ntTSL 414.11□□□□□ -0.153e-7■■■■■ 32.1
DDX24Q9GZR7 SYMPK-206ENST00000596518 592 ntTSL 512.83□□□□□ -0.363e-7■■■■■ 32.1
DDX24Q9GZR7 PAN2-210ENST00000548982 408 ntTSL 313.39□□□□□ -0.274e-7■■■■■ 32.1
DDX24Q9GZR7 UBR1-205ENST00000564540 735 ntTSL 35.62□□□□□ -1.511e-6■■■■■ 32.1
DDX24Q9GZR7 MCM3AP-204ENST00000467026 2671 ntTSL 1 (best)15.78■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 32.1
DDX24Q9GZR7 INPPL1-209ENST00000540973 375 ntTSL 329.88■■■□□ 2.372e-6■■■■■ 32.1
DDX24Q9GZR7 INPPL1-214ENST00000543234 275 ntTSL 226.52■■□□□ 1.842e-6■■■■■ 32.1
DDX24Q9GZR7 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.453e-6■■■■■ 32.1
DDX24Q9GZR7 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 32.1
DDX24Q9GZR7 MBTD1-202ENST00000405860 3224 ntTSL 514.51□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 32.1
DDX24Q9GZR7 MBTD1-203ENST00000415868 5099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.483e-6■■■■■ 32.1
DDX24Q9GZR7 MBTD1-206ENST00000591270 2163 ntTSL 26.25□□□□□ -1.413e-6■■■■■ 32.1
DDX24Q9GZR7 PKD1-209ENST00000472659 661 ntTSL 322.52■■□□□ 1.21e-8■■■■■ 32.1
DDX24Q9GZR7 PFKP-210ENST00000468050 425 ntTSL 318.65■□□□□ 0.583e-9■■■■■ 32
DDX24Q9GZR7 TMEM94-218ENST00000581252 522 ntTSL 513.82□□□□□ -0.23e-7■■■■■ 32
DDX24Q9GZR7 ARHGAP4-213ENST00000460782 496 ntTSL 319.07■□□□□ 0.644e-10■■■■■ 32
DDX24Q9GZR7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.921e-6■■■■■ 32
DDX24Q9GZR7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.81e-6■■■■■ 32
DDX24Q9GZR7 SGSM2-211ENST00000574563 3410 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 32
DDX24Q9GZR7 DOCK2-212ENST00000522138 647 ntTSL 312.63□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 32
DDX24Q9GZR7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.482e-6■■■■■ 32
DDX24Q9GZR7 MFSD10-204ENST00000507272 1575 ntTSL 519.54■□□□□ 0.722e-6■■■■■ 32
DDX24Q9GZR7 MON2-207ENST00000549286 424 ntTSL 514.83□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 32
DDX24Q9GZR7 HNRNPR-213ENST00000641107 646 nt18.33■□□□□ 0.522e-7■■■■■ 32
DDX24Q9GZR7 HNRNPR-209ENST00000476660 1637 ntTSL 1 (best)17.39■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 32
DDX24Q9GZR7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.498e-7■■■■■ 32
DDX24Q9GZR7 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.038e-7■■■■■ 32
DDX24Q9GZR7 ARHGAP4-215ENST00000461739 614 ntTSL 325.28■■□□□ 1.648e-8■■■■■ 32
DDX24Q9GZR7 ABCC1-207ENST00000575422 1198 ntTSL 519.2■□□□□ 0.662e-7■■■■■ 32
Retrieved 100 of 28,409 protein–RNA pairs in 281.9 ms