Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM5Q9C035 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM5Q9C035 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM5Q9C035 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms