Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
KRTAP2-4Q9BYR9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP2-4Q9BYR9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP2-4Q9BYR9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP2-4Q9BYR9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP2-4Q9BYR9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP2-4Q9BYR9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms