Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW5

TIPIN, TIMELESS-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPINQ9BVW5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIPINQ9BVW5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIPINQ9BVW5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIPINQ9BVW5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIPINQ9BVW5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TIPINQ9BVW5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIPINQ9BVW5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIPINQ9BVW5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TIPINQ9BVW5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TIPINQ9BVW5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TIPINQ9BVW5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TIPINQ9BVW5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TIPINQ9BVW5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TIPINQ9BVW5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TIPINQ9BVW5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TIPINQ9BVW5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TIPINQ9BVW5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TIPINQ9BVW5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TIPINQ9BVW5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TIPINQ9BVW5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TIPINQ9BVW5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TIPINQ9BVW5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TIPINQ9BVW5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIPINQ9BVW5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIPINQ9BVW5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIPINQ9BVW5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIPINQ9BVW5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIPINQ9BVW5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIPINQ9BVW5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIPINQ9BVW5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIPINQ9BVW5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIPINQ9BVW5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIPINQ9BVW5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TIPINQ9BVW5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TIPINQ9BVW5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TIPINQ9BVW5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TIPINQ9BVW5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TIPINQ9BVW5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIPINQ9BVW5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIPINQ9BVW5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIPINQ9BVW5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIPINQ9BVW5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIPINQ9BVW5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIPINQ9BVW5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIPINQ9BVW5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TIPINQ9BVW5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms