Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTDSS2Q9BVG9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTDSS2Q9BVG9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms