Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHCHD7Q9BUK0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHCHD7Q9BUK0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms