Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CRACR2AQ9BSW2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRACR2AQ9BSW2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms