Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIKE1Q9BRV8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SIKE1Q9BRV8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIKE1Q9BRV8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms