Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA1CQ9BQE3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBA1CQ9BQE3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA1CQ9BQE3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms