Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TREX2Q9BQ50 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms