Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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KCNS3Q9BQ31 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNS3Q9BQ31 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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KCNS3Q9BQ31 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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KCNS3Q9BQ31 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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KCNS3Q9BQ31 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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KCNS3Q9BQ31 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNS3Q9BQ31 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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